血糖仪是通过感光系统探测试纸上的颜色变化来读出血糖数据，感光系统是特殊玻璃制成，如果用清洁剂等擦洗会影响它对光的感知，因为清洁剂多是碱性的，易腐蚀特殊玻璃上的感光系统。
还有人以为消毒液、酒精、碘酒等擦洗血糖仪会更干净，其实它们和清洁剂一样，也会对血糖仪感光系统产生破坏，影响测试结果。但是采血部位要用酒精消毒，等到酒精完全晾干后再采血，否则蘸上酒精也会影响测试结果。
所以，血糖仪只能用清水擦洗,但不能用清水直接冲洗。
正确的方法是用柔软的布蘸上纯净水（稍微潮湿即可）擦拭血糖仪外部及测试区，切记水不要太多。或者是对测试区先用稍湿的棉棒清洗，然后用干棉棒擦干，清洁过程不能拆开仪器。
另外，存放血糖仪注意保持通风、干燥，如果居住环境比较潮湿，每次取出试纸后要立即盖紧试纸筒的密封盖，以免试纸受潮。